По совету Алексея (см. viewtopic.php?f=1&t=4582) установил второй экземпляр клиента чата на одну машину.
Таким образом: первый экземпляр установлен в C:\Users\usr\AppData\Local\NSS\MyChat Client\
Второй экземпляр - в C:\Users\usr\AppData\Local\NSS\MyChat Client2\
Далее запустил и настроил оба экземпляра на автозагрузку после старта Винды (путем установки соотвествующего чекбокса в меню чата). Перегружаемся и видим, что запустился только один экземпляр (установленный вторым). Смотрим в msconfig и видим, что в автозапуске действительно прописан только один экземпляр чата (второй). Видимо, первый потерся вторым.
В реестре - это выглядит так:
Вручную добавил вторую запись к первому экземпляру, теперь стало норм:
И проверьте, пожалуйста, пути анинсталла для каждого экземпляра в реестре, по-моему они тоже для первого экземпляра затерты вторым.