Для того, чтобы при создании новых учётных записей клиентов и, соответственно, структуры каталогов сервер знал, какой каталог на каком диске использовать по умолчанию, можно указать произвольный каталог. Он будет использоваться при автоматическом создании структуры каталогов при создании учётной записи в "Управлении пользователями".

Также GERMES Server умеет контролировать оставшееся свободное место на дисках, где находятся каталоги учётных записей клиентов сервера.

Эти диски каталоги проверяются при запуске сервера. Если места недостаточно — сервер на запустится. Также производится контроль в процессе работы клиента. Если места на диске меньше критической величины, указанной в настройках — об этом сделается соответствующая запись в файле протокола и клиент будет автоматически отключен при попытке связи. Файлы передаваться не будут.