Да, конечно, смотрите раздел справки сервера: "Установка MyChat сервера как системной службы".
Если у вас новая ОС (Vista, 7, Server 2008, 2012), то GUI вариант сервера следует запускать от имени администратора, чтобы операционная система не свиртуализировала БД MyChat Server (MyChat Server как служба исполняется от имени "System").
Чат со мной